EIAV (EQUINE INFECTIOUS ANEMIA VIRUS) : CARACTERISATION GENETIQUE D'ISOLATS CIRCULANTS DANS LES POPULATIONS EQUINES EN EUROPE ET LESIONS - EPHE - École pratique des hautes études Accéder directement au contenu
Mémoire De Diplôme Année : 2018

EIAV (EQUINE INFECTIOUS ANEMIA VIRUS): GENETIC CHARACTERIZATION OF CIRCULATING ISOLATES IN EQUINE POPULATIONS IN EUROPE AND LESIONS

EIAV (EQUINE INFECTIOUS ANEMIA VIRUS) : CARACTERISATION GENETIQUE D'ISOLATS CIRCULANTS DANS LES POPULATIONS EQUINES EN EUROPE ET LESIONS

Résumé

CONTEXTE DE L’ETUDE. EIAV (Equine Infectious Anemia Virus) est un rétrovirus, appartenant au genre lentivirus, qui infecte les équidés à travers le monde. Il peut entrainer l’apparition d’une maladie nommée AIE (Anémie Infectieuse Equine), une des 11 maladies équines à déclaration obligatoire listées par l'organisation mondiale de la santé animale, soumise en France à une police sanitaire imposant le maintien en quarantaine puis l’euthanasie des animaux séropositifs. Dans ce contexte très réglementé, la mise en place d'une prévention efficace de la transmission d'EIAV nécessite la connaissance des souches virales circulantes. La majorité des foyers européens d’AIE sont en Roumanie, avec plus de 50 000 chevaux séropositifs identifiés entre 1996-2013, suggérant une contamination d’origine roumaine de pays encore récemment indemnes. OBJECTIFS. Bien que connu et étudié depuis des décennies, peu de données sont disponibles pour établir la nature et la diversité génétique d’EIAV à l’échelle mondiale. Dans ce contexte, l’un des objectifs de mon travail de recherche a été de caractériser les souches d’EIAV circulantes responsables de foyers en Roumanie et en France pour appréhender la cartographie d’EIAV en Europe. De même, alors que la transmission par le sang reste la voie d’infection la plus décrite, l’infection par voie aérienne a été suggérée lors d'épisodes infectieux en Irlande. J’ai analysé la présence d’EIAV et des lésions associées dans le poumon de chevaux infectés. MATERIELS ET METHODES. Les lésions pulmonaires ont été analysées sur coupes histologiques de poumon de 93 chevaux roumains et français, séropositifs pour EIAV et ne présentant pas d’épisodes fébriles d’EIAV. L’expression pulmonaire de la protéine de capside d’EIAV a été recherchée par immunomarquage. Le virus a été recherché sur le sang de 75 chevaux roumains et français, séropositifs asymptomatiques ; 25 isolats d’EIAV ont été séquencés dans gag et analysés phylogénétiquement La souche virale d’EIAVFR1478, partiellement caractérisée génétiquement, a été dérivée in vitro. RESULTATS. Nous avons décrit une atteinte pulmonaire interstitielle chez des chevaux infectés par le virus EIAV, associée à une expression de la capside dans les macrophages, les cellules endothéliales et les cellules épithéliales matures du poumon distal, non connues auparavant comme cellules cibles de l’infection. Par l’analyse génétique des virus circulant et par comparaison avec les séquences publiées en Europe, Amérique et Asie, nous avons mis en évidence la circulation de virus distincts en France et en Roumanie, distants entre eux de ~20% de divergence au niveau nucléotidiques et ~15% en séquences déduites en acides aminés, et également distants des souches virales caractérisées en Amérique du Nord, en Italie et en Asie. Nous avons mis en évidence l’existence de clusters génétiques, associés au pays d’origine des chevaux en Europe et sur la base des isolats étudiés, nous avons exclu l’hypothèse d’une contamination d’origine roumaine. Nous avons montré que la variabilité dans le gène gag est importante, notamment au niveau de la région « late domain », essentielle pour la production de particules virales. Enfin, nous avons établi le premier clone biologique français EIAVFR1478, partiellement décrit sa séquence et montré sa réplication dans les cellules fibroblastiques pulmonaires équines et constitue la première souche non adaptée, isolée d’EIAV Français. CONCLUSION. Cette étude a permis de mettre en évidence une atteinte du poumon au cours de l’infection par EIAV, d’élargie le tropisme du virus aux cellules épithéliales alvéolaires et de montrer la diversité des souches circulant en Europe et dans le monde.
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hal-01991983 , version 1 (28-01-2019)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01991983 , version 1

Citer

Christine Dolmazon. EIAV (EQUINE INFECTIOUS ANEMIA VIRUS) : CARACTERISATION GENETIQUE D'ISOLATS CIRCULANTS DANS LES POPULATIONS EQUINES EN EUROPE ET LESIONS. Sciences du Vivant [q-bio]. 2018. ⟨hal-01991983⟩
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