Identification et caractérisation d'ARN régulateurs chez Escherichia coli régulés par RpoS
Résumé
Les bactéries ont la capacité de s’adapter à leur environnement par une régulation fine de leur expression génique. Cette régulation génique s’opère par les facteurs sigma, sous-unités de l’ARN polymérase permettant la discrimination des promoteurs, et de l’aide éventuelle de cofacteurs pour permettre la transcription de sets de gènes spécifiques aux besoins de la bactérie. Les bactéries contrôlent également l’accumulation de leurs protéines, au niveau post-transcriptionnel, à l’aide notamment d’ARNnc permettant de moduler la traduction d’ARNm ciblés, par l’appariement : ARNm-ARNnc. Nous avons montré, grâce aux données obtenues en RNA-seq, ChIP-seq, Northern Blot et de fusions reportrices, que le facteur sigma RpoS induit ou module la transcription de ces ARNnc. Nous avons notamment observé que le facteur sigma RpoS est réprime (indirectement) la transcription de nombreux ARNnc et induisait celle d’au moins un ARNnc. . Afin d’étudier un exemple de conséquences de la régulation transcriptionnelle d’ARNnc par RpoS , nous avons choisi d’étudier la régulation de l’expression des curli, appendices extracellulaires impliqués dans l’adhérence et la formation de biofilm. Nous avons observé que l’expression des gènes csg est régulée à la fois transcriptionnellement et traductionellement par le facteur sigma RpoS et les ARNnc. Nous avons également pu observer une thermorégulation de l’expression des gènes structuraux des curli qui pourrait impliquer ces deux types de régulateurs
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
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