Mécanismes cellulaires d'adaptation des virus Influenza A : Interaction entre protéine virale NS1 et protéines cellulaires

Charlotte Foret -Lucas (1, 2, 3)

1 EPHE - École Pratique des Hautes Études
2 INRA - Institut National de la Recherche Agronomique
3 ENVT - Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse

Les virus influenza A ont été à l’origine de nombreuses pandémies dont quatre ces cent dernières années. Aujourd’hui, nous sommes toujours incapables de prédire l’apparition d’une pandémie. L’adaptation des virus Influenza A (VIA) aviaires à l’Homme dépend en grande partie de la capacité des protéines virales à interagir avec les protéines cellulaires humaines. En effet, les VIA ont la capacité de détourner la fonction des protéines cellulaires pour permettre ou favoriser leur réplication. Néanmoins, si certaines protéines cellulaires sont relativement bien conservées chez l’Homme et les oiseaux, elles ne sont pas identiques et peuvent donc interagir différemment avec les protéines virales La protéine non structurale NS1 est un facteur de virulence important pour les VIA et de multiples fonctions lui sont attribuées comme l’échappement à la réponse immunitaire. C’est également une protéine particulièrement impliquée dans l’adaptation du virus à son hôte. L’objectif de cette étude est d’identifier et de caractériser les interactions entre NS1 et protéines cellulaires aviaires pouvant intervenir dans l’adaptation des VIA à l’hôte voire dans le franchissement de la barrière d’espèce. Dans cette étude nous avons utilisé une approche par co-immunoprécipitation et spectrométrie de masse qui nous ont permis de sélectionner 17 protéines d’intérêt notamment des facteurs d’initiation de la transcription, de répression de la traduction ou encore d’épissage des pré-ARNm. La suite de l’étude s’est portée sur plusieurs de ces protéines, statistiquement les plus susceptibles d’interagir avec NS1 ou ayant été décrites comme partenaire de NS1 ou d’autres protéines virales en cellules humaines. Nous avons cherché à mettre en évidence l’interaction de ces protéines avec NS1 par des approches de de co-Immunoprécipitation, de colocalisation en microscopie confocale et de Proximity Ligation Assay (DuoLink PLA Technology). Les résultats bien que préliminaires nous permettent d’envisager prochainement la caractérisation de ces interactions, à l’échelle moléculaire. De plus, le développement de nouveaux outils technologiques tels que la PLA nous permettront d’identifier et caractériser d’autres partenaires de NS1.

Keywords: Virus Influenza A; aviaire; adaptation; NS1; interactome; poulet; Proximity ligation assay

Domains: Virology

Charlotte Foret -Lucas. Mécanismes cellulaires d'adaptation des virus Influenza A : Interaction entre protéine virale NS1 et protéines cellulaires. Virologie. 2018. ⟨hal-01961588⟩